Grupos de Investigación Reconocidos por Colciencias
  - Bioética, Ciencias de la Vida.
  - Bioéticas
  - Grupos de Investigación en Neurodesarrollo, Salud Mental Intantil, 
    Adolescencia y Familia
  - Salud y Ambiente
  - Educación Superior en Salud

Institutos
   - Genética Molecular Bacteriana (Reconocido por Colciencias)
   - Virología. Clic AQUÍ para más información. (Reconocido por Colciencias)
   - Biología Molecular

Líneas de Investigación Formativa
La Universidad El Bosque es conciente de la necesidad de producción de conocimiento en nuestro país y del compromiso que tiene en la formación del espíritu científico y crítico en sus estudiantes. Por tal motivo ha propuesto desde sus inicios la asignatura de Investigación formativa durante la cual se espera que los estudiantes de Medicina desarrollen habilidades en la identificación de problemas, en la formulación de propuestas investigativas y en la ejecución de dichas propuestas. El enfoque biopsicosocial ofrece la posibilidad de indagar sobre aspectos muy diversos de la realidad colombiana en relación con la salud, lo cual implica la utilización de metodologías y técnicas variadas en la lectura crítica de documentos, la recolección de información, el análisis de datos y la publicación de resultados.

Se espera que desde el tercer año de carrera, el estudiante inicie su proceso y lo haya finalizado hacia el quinto año, el cual favorecerá el trabajo en equipo como estrategia para el desarrollo de habilidades comunicativas y de concertación. Durante estos dos años, los estudiantes tendrán una asesoría permanente en aspectos formales en cuanto tienen que ver con la elaboración de documentos; aspectos metodológicos en relación con las herramientas epidemiológicas, estadísticas, informáticas, de las ciencias humanas y sociales y otras ciencias relacionadas; y aspectos especializados, en relación con cada uno de los temas propios del campo de investigación.

La Facultad de Medicina tiene varios grupos de investigación, algunos de ellos reconocidos por Colciencias en diferentes categorías, al interior de los cuales se pueden desarrollar los proyectos de los estudiantes de investigación formativa. Son entre otros, Bioética – Ciencias de la Vida - Categoría A, Instituto de Virología - Categoría A, Grupo de Investigación en Neurodesarrollo, Salud Mental Infantil, Adolescencia y Familia – Categoría A , Instituto de Genética Molecular Bacteriana – Categoría B y Grupo de Educación Superior en Salud- Categoría C.